在深圳企業(yè)進行注銷后，如何處理員工合同的問題，也是企業(yè)經(jīng)營者需要關注的重點。企業(yè)注銷時，需要清償債務和處理債權，其中員工的勞動合同也必須妥善處理，以保障員工的合法權益。

一、員工合同解除

企業(yè)經(jīng)營者在進行注銷前需要按照《勞動合同法》的規(guī)定，提前通知員工解除合同，并為員工支付完畢應得的工資、離職補償金、年假等福利。

在進行員工合同解除時，可以采取以下幾種方式：

1.協(xié)商解除：企業(yè)經(jīng)營者可以與員工協(xié)商確定解除合同，如以雙方協(xié)商的解除條件為準。

2.依法解除：企業(yè)經(jīng)營者如不能與員工達成協(xié)議，可以依法進行解除。勞動合同法規(guī)定了員工違規(guī)行為和其他情形下企業(yè)可以解除勞動合同的規(guī)定，如員工在工作期間失職、嚴重違反職業(yè)道德或勞動紀律、嚴重違反國家法律法規(guī)等情形下，企業(yè)可以進行依法解除勞動合同。

3.合同到期：如果員工的勞動合同已到期，且雙方無違反合同條款的情況，合同便自動到期。

二、應支付的離職補償金

當企業(yè)進行注銷時，涉及到員工的合同解除，按照《勞動合同法》的規(guī)定，員工需要獲得相應的離職補償金。離職補償金的支付標準為一個月工資的兩倍。

三、兌付員工工資、年假、社保等福利

企業(yè)在注銷前應按照《勞動合同法》的規(guī)定，兌付員工未到期的工資和年假福利，同時也需要終止員工的社會保險關系。為了保障員工權益，企業(yè)可以在注銷前將員工的社會保險費用全額交續(xù)上繳，以兌現(xiàn)員工保險福利。

四、注銷后的員工權益保障

注銷后的員工權益保障也是企業(yè)經(jīng)營者需要關注的問題。企業(yè)應當按照法律規(guī)定辦理員工社會保險關系轉(zhuǎn)移手續(xù)，保障員工基本養(yǎng)老、醫(yī)療、生育、工傷和失業(yè)等社會保險權益。

同時，企業(yè)需要對員工的勞動合同、社會保險關系進行徹底銷毀處理，保證員工個人信息不被泄露。注銷后，如企業(yè)經(jīng)營者依然需要員工服務，應當重新簽訂新的勞動合同，并按照相關法律規(guī)定為員工辦理社會保險和公積金等福利。

總之，企業(yè)注銷過程中需要仔細處理員工合同，保障員工合法權益。企業(yè)經(jīng)營者應當合法有序地解決員工問題，當注銷后需要員工服務時，也需要及時履行新的合同和福利交納等法律義務，以確保企業(yè)員工合法權益得到充分保障。